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Interactions between DNA repair pathways and CRISPR-Cas systems in Bacteria
Par David Bikard
Le 3 Mai 2016 à 11h00 - Interactions between DNA repair pathways and CRISPR-Cas systems in Bacteria
CRISPR-Cas systems confer bacteria and archaea an adaptive immunity against phages and other invading mobile genetic elements. In type II CRISPR-Cas systems, the Cas9 protein introduces double strand ...
Quantitative principles of genome evolution revealed by ancestral genome reconstruction
Par Gilles Fischer (UPMC)
Le 12 Avril 2016 à 11h00 - Quantitative principles of genome evolution revealed by ancestral genome reconstruction
Comparative genomics is a powerful approach to understand genome evolutionacross species. The study of synteny conservation between multiple speciesallowed critical conceptual advances on how genomes ...
Addressing the functionality of adaptation in Chemotaxis
Par Jérôme Wong Ng
Le 5 Avril 2016 à 11h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
A notable feature of bacterial chemotaxis is adaptation : after the application of a step stimulus, the bacterial running time relaxes to its pre-stimulus level. The response to the amino acid ...
Cortical bases of temporal asymmetries in auditory perception.
Par Brice Bathellier
Le 29 Mars 2016 à 11h00 - salle de réunion (LJP, tour 32-33, 5ème étage)
"Sound recognition relies not only on spectral but also on temporal cues as evidenced by the profound perceptual impact of time-reversion on common sounds. To address the coding principles underlying ...
Application des lipides microbiens à l'étude des milieux naturels
Par Arnaud Huguet (UPMC, Laboratoire Milieux environnementaux, transferts et interactions dans les hydrosystèmes et les sols)
Le 22 Mars 2016 à 11h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
Les lipides membranaires d’origine microbienne peuvent permettre de mieux comprendre le fonctionnement hydrogéochimique des écosystèmes terrestres et aquatiques. Les ...
Engineering synthetic developmental patterns: how many ways can you make a stripe?
Par Mark Isalan (Imperial College, London)
Le 15 Mars 2016 à 10h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
Synthetic biology is a promising tool to study the function and properties of gene regulatory networks. Gene circuits with predefined behaviors have been successfully built and modeled, but largely on...
Cell-free transcription-translation: from gene circuits to self-assembly in a test tube
Par Vincent Noireaux (University of Minnesota)
Le 7 Mars 2016 à 11h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
Originally developed to decipher the genetic code and study gene regulation, cell-free transcription-translation (TX-TL) systems are becoming powerful platforms to construct biological systems in ...
Centrosome positioning at the cell center, is it that simple?
Par Manuel Théry (IUH, Hopital Saint-Louis, Paris)
Le 16 Février 2016 à 11h00 - seminar room LJP, tower 32-33, 5th floor
During this seminar I will present the current models of centrosome positioning based on pulling and/or pushing forces produced on microtubules. Then, showing experimental data and numerical ...
From gel reinforcement to gel adhesion
Par Alba Marcellan (Université Pierre et Marie Curie, Laboratoire Sciences et Ingénierie de la Matière Molle, ESPCI ParisTech)
Le 9 Février 2016 à 11h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
Polymer hydrogels can be viewed as containers of solvent, e.g. water, made of a cross-linked network of polymer chains. Gels are interesting objects which combine both liquid-like and solid-like ...
Non-linear optical techniques for biology: applications and developments
Par Aymeric Leray (Laboratoire Carnot, Université de Bourgogne)
Le 2 Février 2016 à 11h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
Non-linear optical techniques are increasingly used for investigating biological phenomena. These techniques allow ultra-deep imaging in tissues with low photo-toxicity. In this talk, I will first ...
Benchmarking inverse statistical approaches for protein structure and design with lattice-protein models
Par Rémi Monasson (Laboratoire de physique théorique, ENS Paris)
Le 26 Janvier 2016 à 11h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
Inverse statistical approaches, modeling pairwise correlations betweenamino acids in the sequences of similar proteins across many differentorganisms, can successfully extract protein structure ...
Flock on a Chip
Par Denis Bartolo (ENS Lyon, Dept de physique)
Le 19 Janvier 2016 à 11h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
I will show how to motorize colloidal particles capable of sensing the orientation of their neighbors and how to handle them in microfluidic chips. These populations of colloidal rollers display ...
Self-organization of rivers and drainage networks
Par Olivier Devauchelle (Institut de Physique du Globe de Paris)
Le 12 Janvier 2016 à 11h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
Alluvial rivers build their own bed with the sediment they transport. Asthey do so, they spontaneously select their size and shape, and organizethemselves into beautifully ramified networks. Despite ...
AG du LJP
Par Membres du LJP
Le 5 Janvier 2016 à 10h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
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Perception des écoulements et des vibrations chez la larve de poisson-zèbre : étude comportementale et imagerie (Soutenance de thèse)
Par Raphaël Olive (LJP)
Le 15 Décembre 2015 à 14h00 - Salle de l'UFR 927 - Batiment B - 1er étage -salle B120.
  Cette thèse de doctorat rend compte du travail réalisé pendant trois ans au sein de l'équipe Imagerie calcique et comportement de la larve de poisson-zèbre ...
Toward microscopic simulations of the cellular environment
Par Fabio Sterpone (IBPC, Laboratoire de Biochimie Théorique, Paris)
Le 8 Décembre 2015 à 10h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
Proteins work in an extremely heterogeneous and crowded environment. Indeed 5 to 40 % of the intracellular total volume is occupied by large biomolecules [1]. This crowding condition affects both the ...
The mechanics of bacterial microcolonies
Par Nicolas Desprat (Laboratoire de physique statistique, ENS, Paris)
Le 1 Décembre 2015 à 10h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
To colonize surfaces, bacteria must adhere and proliferate. How those terms compete to shape the foundations of biofilm formation is barely understood. When bacteria grow between a coverslip and a gel...
Physical limit to concentration sensing in a background of competing ligands
Par Thierry Mora (Laboratoire de Physique Statistique, ENS Paris)
Le 24 Novembre 2015 à 10h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
 Many biological objects, such as transmembrane receptors orgene promoters, sense concentrations of chemical entities by bindingthem specifically. However, in many situations, competing ligands ...
Hierarchical self-assembly of colloidal membranes
Par Thomas Gibaud (ENS Lyon)
Le 16 Novembre 2015 à 11h00 - Salle de séminaires 5ème étagé, Tour 32-33
Nature excels at building complex functional materials. We however are far from understanding thestructure and mechanism involved in those materials and even further from being able to ...
AG du labo
Par -
Le 3 Novembre 2015 à 10h00 - seminar room LJP (tower 32-33, 5th floor)
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Journée scientifique du LJP
Par Membres du LJP
Le 8 Octobre 2015 à 09h30 - Salle de l'UFR de physique
Les permanenet du LJP présenteront leurs sujets de recherche.
All-optical readout and manipulation of neuronal activity by optical wave front shaping
Par Valentina Emiliani (Neurophotonics Laboratory, University Paris Descartes)
Le 28 Septembre 2015 à 14h00 - Salle de réunion LJP, tour 32-33, 5ème étage
 The ability to perturb and manipulate the flow of excitation and inhibition, enabled by a rapidly developing repertoire of optogenetic actuators, is essential for elucidating causal ...
Speedseminar
Par Jonathan Lee Tin Wah (DNA/RNA); Javier Pastenes (Langue artificielle); Jean Ollion (Bactéries); Alexis Dubreuil (Poisson)
Le 21 Septembre 2015 à 11h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
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Reconstructing rodent and human Oriented Neuronal Networks to model Neurodegenerative syndroms
Par Jean-Michel Peyrin
Le 14 Septembre 2015 à 11h00 - Salle de séminaires 5ème étage, Tour 32-33
The brain is a complex structure comprising many different neuron populations making specific and long ranged polarized connections, or synapses.As such, neurons are ordered in exquisitely complex yet...
Lighting up proteins in living systems
Par Arnaud Gautier (ENS, Dept. de Chimie, Paris)
Le 29 Juin 2015 à 11h00 - Salle de séminaires 5ème étagé, Tour 32-33
  Deciphering the complex mechanisms controlling cells and organisms requires effective imaging systems and fluorescent probes to observe biomolecules in real time with high spatiotemporal...
Oxydation de membranes biomimétiques
Par Aurélien Bour
Le 15 Juin 2015 à 11h00 - Salle de réunion (tour 32-33, 5ème étage)
La cardiolipine est un lipide membranaire très abondant dans les tissus subissant un fort stress mécanique ou oxydant. Nous étudions son rôle dans la résistance des ...
A sensory motor loop interfacing the cerebrospinal fluid to central pattern generators in the zebrafish spinal cord
Par Claire Wyart
Le 1 Juin 2015 à 14h00 - Salle de réunion (tour 32-33, 5ème, étage)
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Review: Super-resolution optical microscopy
Par Sergei Kruglik
Le 18 Mai 2015 à 11h00 - Salle de réunion (tour 32-33, 5ème étage)
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Simple self-replicators: growth via self-assembly and fissioning via bursting bubbles
Par Damien Woods (Caltech)
Le 13 Avril 2015 à 11h00 - Salle de réunion (tour 32-33, 5ème, étage)
We explore the principles of and experimentally demonstrate an autonomousand natural scheme for molecular self-replication. The talk will discuss a design for a simple DNA self-replicator that in ...
A blueprint for actomyosin assembly and disassembly during pulsed contractions: imaging single molecules in a developing embryo
Par François Robin (Institut de Biologie Paris-Seine)
Le 30 Mars 2015 à 11h00 - seminar room LJP (tower 32, 5th floor)
Actomyosin-based pulsed contractions are a widespread and highly dynamic form of self-organized contractility that underlies numerous morphogenetic events during early development. However the ...
Efficient coding in recurrent networks
Par Sopie Deneve (Group for Neural Theory, LNC, DEC, ENS)
Le 23 Mars 2015 à 11h00 - Efficient coding in recurrent networks
Cortical responses are hugely variable and heterogeneous. Moreover, the brain is amazingly robust, able to withstand lesions and neural deaths with minimal impact on behavior.  But does that ...
The biophysical basis of morphogenesis: symmetry breaking and elongated forms in plants and fungi
Par Arezki Boudaoud (ENS Lyon)
Le 16 Mars 2015 à 11h00 - Salle de réunion LJP (tour 32-33, 5ème étage)
Despite extensive research, we are far from a comprehensive answer to the question of how cells and organisms adopt well-defined shapes. We addressed this question in the context ...
Le Système International d'Unités, bientôt redéfini
Par Lucile Julien, LKB, Professeur émérite à l'UPMC
Le 9 Mars 2015 à 11h00 - Salle de réunion du LJP (Tour 32, 5ème étage)
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IN VITRO STUDY OF LEUKOCYTES RECRUITMENT EVENTS
Par Olivier Théodoly
Le 16 Février 2015 à 11h00 - salle de réunion du LJP (5-31)
During the immunological response, circulating leukocytes are recruited from the blood system towards inflammatory zones via a complex cascade of events: after exiting the capillary bed, leukocytes ...
-DISCO: How the UVs change my life
Par Mathieu Refregiers, Synchrotron Soleil
Le 9 Février 2015 à 11h00 - salle de réunion du LJP (5-31)
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Intrinsic and extrinsic determinants of axon growth and lamination in retinal ganglion cells
Par Filippo Del Bene
Le 2 Février 2015 à 11h00 - salle de réunion du LJP (5-31)
Retina Ganglion Cells axons project from the eye to the contralateral optic tectum. We will present data illustrating the importance of axonal transport to regulate axon growth via an ...
Mécano-sensibilité des cellules vivantes: rôle de la rigidité de l'environnement sur la migration cellulaire.
Par Benoit Ladoux
Le 19 Janvier 2015 à 11h00 - Salle de réunion du LJP (5-31)
Les forces mécaniques jouent un rôle important dans la croissance et la formation des tissus et des organes qui composent notre corps. La perception qu'ont les cellules vivantes de ...
Vieillissement, relaxation de contrainte et fracture des hydrogels de biopolymère
Par Olivier Ronsin
Le 12 Janvier 2015 à 11h00 - Salle de réunion du LJP (5-31)
Les hydrogels de biopolymère, matériaux constitués d'un réseau de chaînes de polymères réticulées, gonflé par un solvant aqueux, suscitent...
Raman Tweezers Microspectroscopy of Extracellular Vesicles in ~100 nm Range
Par Serguei Kruglik
Le 1 Décembre 2014 à 11h00 - Salle de réunion du LJP (5-31)
 In recent years, the existence of a specific way of cell communication based on the release of membranous nano/micro-sized vesicles has been discovered and acknowledged; and the research in ...
Experimental study of metabolic adaptation in time-structure environments.
Par Jean-Baptiste Boulé
Le 24 Novembre 2014 à 11h00 - salle de réunion LJP (tour 32, 5ème étage)
Life is a history-driven process, pervaded by memories at many scale, from the molecular assembly patterns inside a cell up to the cultural organization of human societies. Memory can be defined as a ...
Multi-protein complexes: functions and constraints
Par Anne-Florence Bitbol (Princeton University)
Le 21 Novembre 2014 à 11h00 - Salle de réunion du LJP (tour 32, 5ème étage)
(Lewis-Sigler Institute for Integrative Genomics and Department of Physics, Princeton University) Self-assembled multi-protein complexes play key roles in cells, e.g., as molecular motors, enzymes, ...
Time-gated detection of near infrared quantum for in vivo cell tracking in small animals
Par Sophie Bouccara (ESPCI)
Le 3 Novembre 2014 à 11h00 - Salle de réunion du LJP (tour 32, 5ème étage)
Le suivi de cellules in vivo est essentiel afin de déterminer par exemple les voies demigration de cellules tumorales circulantes ou encore pour suivre l’activité de ...
Slow fronts at the transition from static to kinetic friction
Par Julien Scheibert - Laboratoire de Tribologie et Dynamique des Systèmes, CNRS / Ecole Centrale de Lyon, Ecully
Le 28 Octobre 2014 à 11h00 - Salle de réunion du LJP
The contact between macroscopic rough solids is made of many micrometric asperities in contact. Under increasing shear force, a catastrophic rupture of the interface can occur through the ...
Biomimétisme de la perception tactile chez le rat
Par Laure Nayélie Claverie (LJP)
Le 27 Octobre 2014 à 11h00 - salle de réunion (tour 32, 5ème étage)
Nous nous intéressons aux mécanismes de transduction de l'information tactile chez le rat qui utilise ses moustaches faciales ou vibrisses pour appréhender son environnement. Nous...
Seeing bacteria grow - from single molecules to cell shape and size
Par Sven van Teeffelen (Pasteur Institute)
Le 20 Octobre 2014 à 11h00 - Salle de réunion du LJP (tour 32, 5ème étage)
Bacterial cell shape is important for cell viability and many biological functions such as motility, host invasion, and biofilm formation. Rod-like Gram-negative bacteria such as Escherichia coli ...
Learning from fluctuations: The mechanics of active and passive cellular assemblies
Par Timo Betz (Institut Curie, CNRS)
Le 13 Octobre 2014 à 11h00 - Salle de réunion du LJP (tour 23, 5ème étage)
Understanding the intriguing complexity of living systems is one of the main driving forces of science. To gain insight we use biomimetic systems that reconstitute well defined cellular assemblies ...
Fluid ratchets and biological locomotion
Par Jun ZHANG (New York University)
Le 10 Octobre 2014 à 11h00 - salle de réunion du LJP (tour 23, 5ème étage)
In this talk, I will discuss a few laboratory experiments that were inspired from examples of biological locomotion.There, solid structures were forced to interact with their surrounding fluid. These ...
Protein fluctuations and phenotypic variability in populations of microorganisms
Par Hanna Salman
Le 30 Juin 2014 à 14h00 - Salle de réunion du LJP (tour 23, 5ème étage)
Populations of microorganisms exhibit wide variability in protein expression that can lead to differences in shape, structure, and behavior. In this talk I will describe the effect of expression ...
Modélisation et simulations numériques de la formation de biofilms phototrophiques.
Par Magali Ribot
Le 16 Mai 2014 à 11h00 - Salle de réunion du LJP (5.31)
Dans cet exposé, nous cherchons à obtenir un modèle hydrodynamique reproduisantla croissance de biofilms  de cyanobactéries se développant au fond de ...
Sensory representations in spiking networks: matching encoding and decoding
Par Fleur Zeldenrust
Le 13 Mai 2014 à 14h00 - Salle de réunion du LJP
In computational neuroscience, a key question is how information is represented in the activity of neurons (spike trains). Many questions about the nature of this 'neural code' remain open, for ...

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